کتاب عبقات دارای دو منهج و هر منهج نیز مشتمل بر مجلداتیست؛ منهج اول درباره اثبات دلالت آیات متعدد قرآن مجید بر امامت و خلافت و حجّیت بلافصل امیر المؤمنین علی و فرزندانش علیهم السلام است، این منهج هنوز به چاپ نرسیده است و در کتابخانه مؤلف در شهر لکهنو نگهداری می‌شود
منهج دوم کتاب درباره احادیثی است که مولوی عبدالعزیز دهلوی در کتابش، مغرضانه و عوام فریبانه اصل یا تواتر آنها را انکار و اشکالاتی بر این احادیث وارد کرده بود؛ این منهج از کتاب شگفت‌آور و قطور عبقات الانوار، بارها در هندوستان و ایران به چاپ رسیده است
روش میرحامد حسین در نگارش این کتاب بدینگونه میباشد که ابتدا مطلب مورد ادعای کتاب تحفه اثنا عشریه را دقیق و کامل بیان میکند آنگاه به پاسخ به آن میپردازد که در این رد و پاسخ، نخست سند احادیث مورد بحث (ثقلین، ولایت، غدیر، باب...) را بررسی میکند و آنگاه به اثبات تواتر و قطعی الصدور بودن، تنها از طریق اهل سنت و کتابها و مدارک معتبر آنان میپردازد و در این مورد، اسامی راویان آن حدیث را از قرن دوم تا قرن سیزدهم (عصر خود) براساس قرن و با ذکر تاریخ وفات بیان و سپس حدیث مورد روایت آن راوی را ذکر مینماید و بعد به معرفی راوی، اعم از صحابی، تابعی، عالم و مؤلف میپردازد و نظرات صاحبان تراجم و شرححال نگاران را در خصوص او بیان و حتی بعضی از کتابهای اهل سنت مانند مسند احمد، الامامة و السیاسه ابنقتیبه و ... را نیز معرفی میکند، در پایان متن حدیث و دلالت آن را بر وفق نظر شیعه بررسی و تحلیل میکند
اسناد کتاب عبقات الانوار از کتب و مصادر خود اهل سنت است و از چنان قوت، جامعیت و اتقان بالائی برخوردار است که هیچگاه عالمان هماندیش مولوی عبد العزیز و شاگردان وی را یارای مبارزه و پاسخ به آن نبوده است و لذا بعد از تألیف عبقات ردیه ای بر آن نوشته نشد! و علمای اهل سنت تا زمان حال از این کتاب گریزانند و پیوسته در صدد نابودی نسخ آن بر می آمدند
علامه میر حامد حسین کتاب عبقات را به آسانی و با رفاه و همراهی خدمه و گروه تحقیق ننوشت، او در راه تألیف چنین کتاب عظیمی، خود به تنهایی سخت‌ترین سفرها و پر زحمت‌ترین کارها را عاشقانه پذیرفت، چرا که همه اسناد و منابع تتبّع و تحقیق از کتابها و منابع اهل سنت را در اختیار نداشت؛ مثلا برای دست یابی به کتابی از منابع اهل سنت شرط عجیب صاحب کتاب را پذیرفت و مدتی به عنوان خادم و کارگر در خانه عالِم سُنی خدمت کرد تا بتواند به کتاب دست یابد! در قضیه ای دیگر به مصر رفت و کتابی را که می‌خواست پیدا کرد و با کشتی برگشت، در مسیر برگشت ناگهان خود را بی مهابا به دریا انداخت و تا پای غرق شدن پیش رفت، وقتی همسفران او را گرفتند و در کشتی نشاندند و سؤال کردند که چرا خودت را به دریا پرت کردی، کتاب را نشان داد و گفت به خاطر این کتاب که به دریا افتاده بود! این کتاب هنوز هم درکتابخانه ناصری نگهداری می‌شود. او حتی وقتی فرزند جوانش از دنیا رفت، مراسم کفن و دفن و تشییع و سوگواری را به دیگران واگذارد تا یک ساعت هم که شده وقتش را جز در تألیف عبقات الانوار صرف نکند
عدو شود سبب خیر گر خدا خواهد... افتراات و اکاذیب مهمل مولوی عبد العزیز دهلوی سبب تألیف چنین اثر گرانقدر و عظیمی شد و کتاب عبقات الانوار طی سالیان متمادی افراد بسیار زیادی از اهل سنت را شیعه گردانید و سالیان سال است که همچون کابوسی به جان علمای اهل سنت افتاده و آسودگی خیال را با سلاح علم و استدلال قاطع از آنان ربوده...
